Про АВТФ не знаю, а на ФПМИ нагрузка в семестре сравнительно небольшая. Но только для своих, которых уже знают вдоль и поперек. А вот человеку с другого факультета, скорее всего, будет очень тяжело, так как придется осваивать много достаточно специфичных вещей. Плюс еще многое зависит от выпускающей кафедры, их для магистратуры три. Второй момент, набор на бюджет идет по рейтингам студентов, т.е.элементарно предпочтут своих же студентов, которые в магистратуре просто продолжат свои бакалаврские работы.

Что-нибудь реальное и полезное сделать не только можно, но даже нужно. А существенной разницы между работой при кафедре или в лаборатории какого-нибудь НИИ из Академгородка – нет. Но есть и то и другое.