это иногда необходимо для того что бы скрыть файловую структуру проекта ну и для удобства. в nginx делается с помощью location, в апаче в файле httpd.conf это делается с помощью alias

Alias /style/ /home/site.ru/system/application/assets/style/

и теперь можно просто грузить файлы стиле src="/style/common.css" и не надо писать полный путь.

можно ли сделать тоже самое только с .htaccess? что типо

<Files ~ "\.(css|js)$">
и тут уже указываем полный путь
</Files>